农业服务公司与进出口贸易公司在纳税义务上存在差异。商贸公司如果不是一般纳税人，便无法开具增值税发票。易贸公司则属于一般纳税人，即使每月没有业务也需要进行零报税。这是因为其性质决定了年底必须缴纳一定的税款。

商贸公司和经贸公司在经营范围上存在显著不同。商贸公司主要在商品领域注册，不得涉及工业、制造等领域；而经贸公司的经营范围更广，可以经营商贸公司无法涉及的领域，如工业和服务业。

在对外经营方面，商贸公司主要从事商业贸易，不包括工农业，一般也不拥有对外贸易资格；而经贸公司则包含工农业和商业，并具备对外贸易资格。

商贸公司主要从事货物的买卖和流通，简单地说就是货物的购销。而经贸公司的业务范围除了货物买卖，还包括服务、投资、地产等行业，其经营范围比商贸公司广泛得多。从范围上看，商贸公司的业务范围属于经贸公司的范畴之内。

报关行是专门负责报关业务的单位，为外贸公司和工厂代理报关。而外贸公司则具备对外贸易经营资格，业务主要在国外，通过市场调研将国外商品进口到国内销售，或者收购国内商品销售到国外。外贸公司还可以为没有进出口权的单位提供进出口代理服务并收取代理费。简单来说，报关行主要是申报单位，没有贸易行为；而外贸公司有贸易行为，但没有向海关申报的权利。

在外贸企业的类型方面，我国主要有外贸公司、生产企业、科研院所、商业物资企业和外经企业等。随着我国外贸体制改革的深化，有关部门放宽了外贸经营权的限制。目前仍实行审批许可制度的情况下，符合条件的生产企业、科研院所和其他经济实体被加快赋予进出口经营权。

对于合作社而言，可以申请自主进出口权。例如，私营生产企业如果满足一定条件，如注册资本和净资产达到一定金额，并且连续两年年销售收入和出口供货额达到一定水平，就可以申请自营进出口权。申报程序包括向相关部门提交报告、企业章程、营业执照等材料。

我国合作社做出口业务的主要模式包括找代理商代理、靠龙头企业以及龙头企业领办合作社等。虽然目前我国做出口业务的合作社所占的比例还很小，但其优越性已经开始显现。例如，以合作社名义出口可以减少贸易壁垒，提高产品信誉度。合作社在办理出口过程中还需要注意核实出口产品是否在进口国的进口商品目录中、了解进口国对于农药残留问题的标准以及保证产品供应等问题。

根据增值税暂行条例，农药作为防治农林业病虫害、除草及调节植物生长的重要药剂，包括农药原药和制剂，如杀虫剂、杀菌剂等，其使用范围决定了是否享受免税待遇，而非单纯依据成分划分。对于虽含有相同成分但用途不同的药剂，则无法享受免税优惠。未达到起征点的也予以免征增值税。

关于增值税的减免权限，国务院拥有最高决策权，任何地区、部门均无权擅自减免。但各省级国税局可根据本地实际情况在规定的范围内确定适用的起征点。除法定免税项目外，财政部、国家税务总局等部委经国务院批准，陆续发布了一系列新的减免政策。

具体来说，基建单位和从事建筑安装业务的企业附设的加工厂、车间，在建筑现场制造的预制构件，若直接用于本单位或该企业的建筑工程，可免于征收增值税。因转让著作权而发生的销售电影母片、录像带母带等业务，以及转让专利技术和非专利技术的所有权而销售计算机软件，也不征收增值税。经国家版权局注册登记的计算机软件产品，在销售时一并转让著作权、所有权的，只需征收营业税，免征增值税。

供应或开采未经加工的天然水，如水库供应农业灌溉用水、工厂自采水用于生产，也无需缴纳增值税。对电信部门及其下属公司销售电话号簿业务收入、销售给军队、的军事用品等，也均免征增值税。残疾人用品、利用废渣生产的建材产品、中国图书进出口总公司销售给科研机构和大专院校的进口科研、教学书刊等，也都在免征增值税的范围内。

农村电管站收取的农村电网维护费、农膜、种子、化肥、农药、农机等农业生产资料，也享受免征增值税的优惠。国家计划内进口的化肥、农药同样免征进口增值税。黄金生产和销售单位销售的部分黄金和黄金矿砂也免征增值税。高校后勤实体为高校师生食堂提供的粮食、食用植物油等，以及校办企业生产的用于本校教学科研方面的应税产品（不包括消费税应税产品），同样享受免征增值税的待遇。

除此之外，铁路系统内部单位为本系统修理货车的业务、废旧物资回收经营单位销售其收购的废旧物资等，也都不需要缴纳增值税。对于外国和国际组织无偿捐赠在国内采购的货物、驻华使领馆运进的公务用品等，也都享受免征增值税或进口增值税的优惠。中远集团的轮船修理业务、国家专业运动队进口或国际组织和国外赠送赞助的体育器材等，同样不需要缴纳增值税。对于青藏铁路建设、非典捐赠物资等特定情况，也有相应的免征增值税政策。还有一些特定商品和服务的增值税减免政策，如暂时调整国内企业生产销售的尿素产品增值税等。