5000万基金公司注册是一个庞大而复杂的过程，需要按照相关法律法规和程序进行。下面将从公司设立、注册资本、申请材料和注意事项等方面详细阐述。

一、公司设立

首先，确定基金公司的名称和经营范围。名称要符合相关规定，经营范围要明确，并根据实际情况选择主营业务。然后，组建创始团队，确定公司法定代表人和高级管理人员。这些人员需要具备丰富的金融、法律和管理经验。

接下来，需要与当地管理部门协商并办理相关手续，获取基金管理业务许可证和基金公司牌照。这包括递交申请、缴纳相关费用，并接受监管部门的审查和核准。在这个过程中，需要完整而准确地填写各种申请表格和文件。

最后，在完成基金公司设立的所有程序后，需要及时办理公司营业执照和税务登记证等相关证件。

二、注册资本

基金公司注册资本的金额是注册过程中的一个重要环节。根据相关规定，基金公司的注册资本应不少于5000万元人民币。注册资本的来源可以是创始股东的出资、股权投资者的出资或其他合法渠道的资金。

注册资本的出资方式可以选择一次性全部出资或分期出资。无论采取什么方式，都应该按照相关规定办理相应的手续。这包括出资人的签字、出资额的明确以及资金的存入银行账户等。

此外，注册资本的出资人应当提交相关证明文件，如个人身份证明、公司章程、出资人之间的协议等。这些文件需要符合法律法规的规定，并经过监管部门的审查和认可。

三、申请材料

在进行5000万基金公司注册时，需要准备一系列的申请材料。首先，需要提交基金公司注册申请书，包括公司名称、经营范围、注册资本等基本信息。此外，还需要提供基金公司章程、创始股东和高管人员的身份证明、资产证明以及公司董事、监事和经理的情况介绍等。

对于注册资本的来源，需要提供资金来源证明，包括存款证明、出资人资产证明和出资意愿证明等。同时，还需要提交风险揭示书、内部治理结构和业务运营计划等。

所有的申请材料都需要经过严格审核，确保信息真实、准确和合法。申请材料的不完整或虚假将会导致注册失败或监管部门的警告和处罚。

四、注意事项

在进行5000万基金公司注册的过程中，有一些重要的注意事项需要特别关注。首先要确保选择的公司名称不与现有公司重名，并且符合相关规定。此外，注册资本要确保足额，避免因注册资本不足而导致注册失败。

在准备申请材料时，要求仔细提供真实、准确和完整的信息。任何虚假或隐瞒的材料都可能导致注册失败或监管部门的处罚。

同时，在整个注册过程中要与当地管理部门保持良好的沟通和合作，及时处理和回应他们的要求和问题。还应及时缴纳各项费用，并保留好所有的相关证明和收据。

综上所述，5000万基金公司注册的过程包括公司设立、注册资本、申请材料和注意事项等方面。这是一个复杂而细致的过程，需要仔细准备和遵循相关法规。只有在确保所有的要求和步骤都按照规定办理，才能成功注册一个基金公司。