公司运营不当可能会被列入工商局黑名单，导致无法新设公司，甚至法定代表人也会受到诸多限制。一旦被列入黑名单，公司的法定代表人将无法领取养老保险金、办理按揭贷款购买房产以及办理移民等。公司也无法开具国税、地税发票，若存在未缴税款，企业法人代表将被限制出境，无法乘坐飞机和高铁。长期不经营的公司，发票机会被锁定。若公司被列入经营异常名录，所有对外申办业务都将受到限制。

在法律上，注册公司原则上必须经营，长时间不经营可依法吊销。但实践中，如果公司注册后只是放在那里不管，是不被允许的。只要银行账户没有资金流动，可以进行零申报，但只要有资金流动就必须做账。申报是必须的。企业的零申报在半年到一年内都算正常，但长期零申报的话，税管员会联系企业了解运营情况。若长期没有业务或企业实际已不经营，税管员会建议企业注销。

根据《中华人民共和国公司登记管理条例》第六十八条，公司成立后无正当理由超过6个月未开业或开业后自行停业连续6个月以上的，可以由公司登记机关吊销营业执照。对于公司注册后两年没有经营和报税的情况，需要了解相关税务规定。即使公司没有实际经营和应税行为，也不用缴税，但也需要记账报税。是否需要缴税是一种结果，需要向税局提供产生这种结果的过程和依据，因此每个月和每个季度的税务申报是非常重要的。

如果公司长期不经营且不报税，会出现税务异常，并且长时间不处理会进入税务局黑名单。还有可能面临营业执照被吊销的风险。银行账户也可能被冻结。如果公司被吊销营业执照，需要进行清算组备案、登报公示、注销税务、注销营业执照等步骤。如果不处理，公司无法继续经营，法人和股东也可能面临生活和职业生涯的影响，例如不能乘坐飞机和高铁等。注册公司后需要按时记账报税，如果没有特殊理由不能私自停业。如果不打算经营，建议及时注销。根据您的税务部门的政策规定，如果您的公司连续三个月或者一年内连续零申报六个月，将会被税务部门进行审查。如果税务部门无法联系到您，您的公司将会被标记为“非正常户”，这可能意味着即将被列入黑名单，甚至公司执照会被吊销。

依据法律规定，“公司成立后无正当理由超过六个月未开业，或者开业后自行停业连续六个月以上的，可以由公司登记机关吊销营业执照。”长时间零申报可能会导致您的营业执照被撤销。即使营业执照被撤销，您仍然需要缴纳相应的税款和费用。

很多可能会误以为公司执照被吊销后会自动注销，其实并非如此。根据规定，被吊销营业执照的公司必须在十五日内注销税务，并前往国税局和地税局补缴之前拖欠的税款和滞纳金。否则，将会面临更严厉的处罚。

如果公司营业执照被吊销后需要进行注销，公司的法人代表和股东将会受到牵连。不仅仅是罚款那么简单，法定代表人甚至在未来三年内不得申请或担任其他企业的董事、监事等高级管理人员。

如果公司的注册资本未缴纳到位导致强制执行，股东的征信将会受到影响，特别是在进出境和贷款方面。工商、税务、公安和银行等多方面的联合惩罚，将会让失信者寸步难行。

建议您在公司注册后积极进行经营和报税，以避免后期面临不必要的困难和麻烦。合规经营，诚信纳税，是每一家公司应该秉持的原则。