对方注册公司在您的公寓进行合法经营，通常不会对房东产生负面影响。但在出租公寓时，合同中应明确禁止承租人从事违法活动。若承租人的公司出现违法行为，房东可能需作为证人或调查对象参与法律程序。

依照《中华人民共和国公司法》，公司设立需经相关机关发放营业执照，该执照应明确公司的基本信息。一旦公司营业执照的信息需要变更，必须依法办理变更登记并换发新执照。

如果您的公寓被他人用于注册公司而您对此并不知情，可以采取以下措施解决问题：

尝试联系使用您公寓地址注册公司的负责人，要求其更改注册地址或注销公司。如果对方愿意配合，问题可以较快解决。

若无法联系到对方或对方拒绝配合，您可以准备相关证据，例如身份证和房产证原件，前往房屋所在地的市场监督管理局（原工商局）进行投诉，说明情况并要求市场监管部门介入调查。

市场监管部门可能会要求您提供进一步证明您是该房产所有者的证据。一旦您的诉求得到确认，市场监管部门可将该公司列入经营异常名录并要求其更正注册信息。

您亦可选择通过法律途径解决问题，例如向法院提起诉讼，要求该公司停止使用您的房产地址并赔偿损失。

为避免类似情况再次发生，建议您在物业管理处或社区登记房产状态，明确表示不允许将其用于公司注册目的，作为预防措施之一。

查询公寓是否注册了公司，可采取以下方法：

1. 直接查询公寓地址：根据《中华人民共和国公司法》相关规定，公众有权向公司登记机关申请查询公司登记事项。可以直接向公寓所在地的公司登记机关（通常是市场监督管理局或工商行政管理部门）查询该地址是否已注册公司。部分地区已开通线上查询服务，如通过支付宝的“市民中心”功能进行查询。

2. 咨询物业公司或小区管理处：了解公寓是否已被注册为公司地址。

3. 使用企业信用信息公示系统查询：访问“国家企业信用信息公示系统”，在查询框中输入公寓地址进行搜索。

4. 咨询当地房屋管理部门或相关机构：如以上方法无法解决问题，建议咨询当地相关部门获取更准确信息。

40年产权的公寓一般可以注册公司。根据相关规定，商业性质的房屋均可注册公司。但请注意，不同城市的规定可能有所不同。

购买公寓的好处包括配套齐全、功能齐全以及方便出租。对于刚进入社会的年轻人来说，购买公寓是一个很好的选择。至于公寓的首付，一般是房屋总价的50%，因为公寓属于商用性质，只能使用商业贷款。

在选择购买或租赁公寓时，请务必了解房屋楼盘土地的用途、产权年限以及贷款政策等相关信息。