一、税务登记问题

在北京公司注册转让中，税务登记是首要考虑的问题。新公司需及时办理税务登记手续，包括税务登记证、税控设备申领等。税务登记证是公司纳税的有效凭证，也是开展日常经营活动的必备条件之一。

首先，新公司需要到所在地的税务局办理税务登记。根据国家税务局规定，公司注册转让需要准备相应的材料，如公司营业执照、办公场所租赁合同、法定代表人身份证明等。同时，还需填写相关申请表格，并进行信息录入、系统审核等程序。在材料齐全且符合规定后，税务局将核发税务登记证，并颁发税控设备使用凭证。

需要注意的是，税务登记不仅仅是一次性的手续，还需要定期更新纳税人信息，并履行相应的纳税申报义务。因此，在注册转让后，新公司应及时办理税务登记相关变更手续，确保纳税人信息的准确性和及时性。

二、资产过户及相关税务处理

在北京公司注册转让过程中，涉及资产过户的问题也需要妥善处理，以避免造成税务风险。

首先，对于资产过户的交易，需要根据税法规定进行相关税务处理。按照国家税务总局的规定，企业之间资产过户交易需要履行增值税和企业所得税的申报缴纳程序。买方在办理资产过户时，需要向税务机关申报购买资产的成本，同时需要缴纳相应的增值税。卖方在将资产过户时，则需要纳税机关核定出售资产的收入，并缴纳相应的企业所得税。

其次，对于特定行业可能存在的涉税特殊规定，新公司也需特别关注。比如，在房地产行业，购买房产后需要按照国家税务总局规定，办理不动产登记和相关税收申报等手续。

因此，在资产过户过程中，新公司注册转让方需要与卖方公司进行充分的沟通和协商，明确各自的纳税义务和责任，确保税务处理的合规性和准确性。

三、员工福利与个税问题

公司注册转让过程中，员工的福利和个税问题也需要妥善处理。

首先，在北京公司注册转让中，新公司对原公司员工的福利待遇可以参考原有的相关协议和政策。需要注意的是，按照劳动法和相关法规的规定，新公司不能随意改变原有员工的劳动合同和福利待遇，应保障员工的合法权益。

其次，员工个税问题也需要关注。在注册转让后，新公司要办理员工的个人所得税税务登记，核定申报纳税义务，并按时缴纳个人所得税。

对于高级管理人员或股东持股转让的情况，还可能涉及到个人所得税的资产转让所得等税务处理问题。这时，新公司需要在税务机关的指导下，按照税法规定核定个人所得税的纳税义务，并履行相关申报和缴税手续。

四、递延税款处理

在北京公司注册转让中，递延税款是一个需要特别关注的税务问题。

递延税款是指因在利润报表中确认某项收入或费用时而产生的暂时性税额差异，导致企业目前不需要缴纳的税款。新公司在注册转让过程中，如果涉及递延税款的情况，需要合理规划和妥善处理。

合理规划公司的利润结构，分析各项会计政策对递延税款的影响，可在注册转让过程中减少或避免递延税款的产生。此外，通过进行税收尽职调查、应用税收优惠政策等方法，也能够降低递延税款的负担。

总之，在北京公司注册转让过程中，税务问题需要公司充分了解并妥善处理。应根据适用的税法规定，正确办理税务登记手续，合理处理资产过户及相关税务，解决员工福利和个税问题，合理规划和处理递延税款。只有确保税务问题的合规性和准确性，新公司才能顺利进行注册转让，并顺利开展日常经营活动。